上海市第六人民医院、上海交通大学附属第六人民医院建于1904年，内设上海交通大学市六临床医学院、上海市四肢显微外科研究所、上海市糖尿病研究所、中国上海国际四肢显微外科培训中心和上海市医学超声培训中心。医院为上海交通大学、上海中医药大学及苏州大学的研究生教育基地；也是全国医学进修基地之一；承担25项国家级继续医学教育项目。现设博士后流动站培养点8个，博士点24个，硕士点40个。先后成立上海市创伤骨科临床医学中心、上海市糖尿病临床医学中心、介入影像学市重点学科及上海市急性创伤急救中心、上海市传染病专科诊治中心。医院的放射科、超声医学科、泌尿外科、耳鼻咽喉科、心内科、血液科、普外科、核医学科、麻醉科为医院重点学科。医院为全国文明单位、全国五一劳动奖状获得单位和全国花园式单位。
医院开放床位1650张，设有33个临床科室、9个医技科室，还有20个研究室。目前拥有工程院院士1位，博士生导师34位，硕士生导师83位，年招收硕、博士研究生150名。临床及科研齐头并进，历年来获得国家、部、市级等科技成果奖近140项。
1963年陈中伟教授、钱允庆教授等在我院成功地施行了国际医学史上第一例断肢再植手术，从此医院被誉为我国断肢再植的摇篮。20世纪五十年代末周永昌教授等开创了超声医学事业，被誉为“中国超声诊断发源地”。1978年，于仲嘉教授研究成功“手或全手指缺失的再造技术”，荣获国家发明一等奖。1980年医院成功地培养了国内第一株胃癌细胞株。内分泌代谢科项坤三教授从事及参与了世界第一个青年起病的成人型糖尿病的致病基因的染色体定位和世界第一个2型糖尿病相关基因的研究；首次在国内发现了线粒体基因突变糖尿病。2003年12月，项坤三教授当选为中国工程院院士。
目前，医院正朝着以四肢显微外科、创伤骨科、糖尿病诊治研究和介入影像为重点，以多器官功能衰竭防治、心血管疾病诊治、血液病骨髓病理、尿道修复重建、鼾症诊治技术、内耳显微技术、重度颅脑损伤抢救、心胸外科微创治疗、肿瘤综合诊治、肝胆胰胃、乳腺疾病治疗、危重孕产妇救治以及泌尿道超声、放射神经介入、核素显像和治疗等为医疗特色，医教研防全面发展的现代化综合性医院的目标奋进。
医院以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，以科学发展观为统领，以促进和加快医院建设和发展为主题，坚持公立医院正确的办院方向，充分体现公益性职能；坚持按照医院建设和发展规律，全面提供医院综合实力，促进医院可持续发展；坚持推进医院所有权和经营权适度分离的体制改革和以人事、分配、后勤社会化为主要内容的内部运行机制改革；坚持有效控制医疗费用不合理增长，努力减轻病人负担，进一步提供优质、便捷、价格合理的医疗服务；坚持调动医院各级干部和广大医务员工的积极性、创造性，增强凝聚力和向心力；坚持总体规划，分步实施，开拓创新，扎实推进。
要把医院建设为领导班子坚强，职工训练有素；专家队伍强大，人才结构合理；学科体系完备，科教实力雄厚；质量服务上乘，硬件设施优良；管理品牌显著，社会较为满意的上海交通大学附属医院，立足上海、服务全国、面向世界，逐步把医院建设成高质量的上海市文明单位、高水平的上海市特大型医疗中心。与国际大都市相匹配，坚持医、教、研、精神文明建设全面发展，充分体现公立医院办院性质的上海著名、全国知名、具有国际影响力的综合性、现代化、花园式医院。