系统生物医学研究中心成为“国家队”

国内第一个按照大科学模式组建

期次:第1240期       查看:683

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  (上接第1版)与国际合作者联合发表一批重要论文“中心”与英国帝国理工大学的国际代谢组学开拓者Nicholson教授以及浙江大学第一附属医院、中国人类基因组南方中心和武汉物理与数学研究所5个科研机构的科学家们组成多学科交叉研究团队,经过近3年的联合攻关,在肠道菌群与人体健康关系的研究中取得了重要进展。通过对一个四世同堂的中国家庭7位成员的肠道微生物组成和人体代谢特征进行详细分析,初步鉴定出肠道内参与了人体代谢过程的一些重要的细菌。有关论文已经发表在国际权威学术杂志《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。
  这个新的研究方法是“人体系统生物学”的一项重要进展。有了这样的方法,通过对一个比较大的人群的每个个体的菌群和代谢同时进行长时间的跟踪分析,可以发现人体从健康状态向慢性疾病如癌症和代谢综合症发展的过程中出现的特征性的变化,作为“病前状态”的生物标记用于公众健康问题的有效的预警和预防,并可用于阐明中医药的临床效果,为中医药走向国际社会服务。这些工作发表后得到学术界的关注。美国合众国际社、新华社等多家国内外媒体对PNAS论文做了报道和介绍。Nature Review Microbiology在今年的4月号上对该论文作为研究亮点给予了评介。发表以后的连续2个月,这篇文章都排在PNAS网站50篇被阅读最多的论文之中(The 50 most read papers)。
  另外,中心与瑞士雀巢公司国际研发中心合作,建立了把人的肠道菌群移植到无菌猪肠道的技术方法,而且用分子生态学技术证明人的菌群可以在猪的肠道里正常定植,用代谢组学技术显示人源菌群猪的代谢特征逐步向人体靠近。从而构成了带着人体菌群的仔猪模型。对于深入研究微生物与宿主的分子互作、探讨营养、菌群和代谢的关系、阐明菌群在药物的药理和毒性作用中的地位、促进中医药现代化等都具有十分重要的意义。该结果发表于Nature出版集团(NPG)与国际微生物生态学会(ISME)联合创办的新刊物The ISME Journal上。
  Nature6China(自然中国)网站对上述两篇论文都作为研究亮点做了评介。与国际合作者联合申请科研项目2005年10月,“中心”的科学家作为主要成员参加了在巴黎召开的“人类元基因组计划圆桌讨论会议”,对国际人类元基因组研究起到了重要的推动作用。2006年10月经陈竺院长向科技部建议,法国前总统希拉克访华期间,科技部与法方签署“中国科学技术部与法国国家研究署关于肠道元基因组的科研合作声明”。2007年1月13-19日,法国农科院(INRA)代表团访问“中心”,与我方联合举办了“中法人体肠道元基因组研讨会”,并与我国科学家进一步深入讨论了双方合作的重点和计划。法国代表团在北京受到刘燕华副部长的亲切接见。对此双边合作,法国方面已经落实2百万欧元予以支持,邀请我国科学家赴巴黎对申请书进行了联合遴选和评审,完成了立项工作,并在2008年2月启动。由我国科技部国际合作司牵头协调、社发司和国家基金委以及上海市从多个渠道对中法肠道元基因组合作给予了支持。到目前,已经申请到的项目总经费合同额为1100万元。为以肠道元基因组为核心的人体系统生物学研究的快速发展奠定了很好的经费基础。
  目前,我们与中科院营养所等单位合作,已经在上海地区开始了一个有1000个志愿者参加的、国际上规模最大的“营养、菌群与肥胖关系的流行病学调查和采样试验”,进展顺利。美国国立卫生研究院与欧盟于2007年12月9日-10日,在美国华盛顿召开国际人类元基因组联盟成立大会。会后成立了“国际人类元基因组联盟”筹备委员会,由于科技部支持的中法元基因组合作在国际上备受关注,我国作为主要发起国参加筹备工作。科技部国际合作司邢继俊处长和“中心”赵立平教授作为筹备委员会委员代表我国政府和科技界参加筹备工作。
  2008年8月在澳大利亚召开的国际微生物生态学会第12届大会上,赵立平将担任“人体微生物组”会议的主席,并做主题报告,标志着我院在这个方向的工作得到国际学术界的认可。
  我们与英国帝国理工Nicholson教授联合申请的科技部支撑计划中医药系统生物学国际合作项目也已经获得批准,正在积极推进。利用国际合作培养了交叉学科人才毕业于比利时布鲁塞尔自由大学的张梦晖博士具有药学专业背景和化学计量学的高水平的训练。2006年7月,她赴英国帝国理工大学在Nicholson教授实验室进行了近2个月的合作研究,利用该实验室的条件,对我们获得的人体系统生物学的数据进行了分析,为有关高水平论文的发表奠定了基础,同时在利用模式识别和多变量统计学等方法研究人体健康方面积累了宝贵的经验。
  生命学院的博士生申剑,根据中心与雀巢公司签订的协议,受雀巢公司博士奖学金资助,先后在瑞士雀巢研发中心的代谢组学中心进行了将近2年的研究工作,并得到雀巢公司学术顾问Nicholson教授的悉心指导,通过研究人源菌群仔猪模型的代谢变化,已经基本掌握了用核磁共振开展代谢组学研究的技术,对于我们用该技术进行大规模的功能元基因组学研究以及人体健康测量是目前十分难得的技术人才。 (上海系统生物医学研究中心 生命学院)